1、跨地区成立的非法人分支机构，企业所得税征管归属哪里？
答：《国家税务总局关于调整新增企业所得税征管范围问题的通知》（国税发〔2008〕120号） 规定：“二、对若干具体问题的规定（二）2008年底之前已成立跨区经营汇总纳税企业，2009年起新设立的分支机构，其企业所得税的征管部门应与总机构企业所得税征管部门相一致；2009年起新增跨区经营汇总纳税企业，总机构按基本规定确定的原则划分征管归属，其分支机构企业所得税的管理部门也应与总机构企业所得税管理部门相一致。”
2、享受企业所得税优惠事项的纳税人办理优惠备案的时限是如何规定的？
答：根据《国家税务总局关于发布<企业所得税优惠政策事项办理办法>的公告》(国家税务总局公告2015年第76号)第七条规定，企业应当不迟于年度汇算清缴纳税申报时备案。
3、跨省经营的汇总纳税人，分支机构享受研发费用加计扣除，该优惠应由总机构备案还是分支机构备案？
答：根据《国家税务总局关于发布<企业所得税优惠政策事项办理办法>的公告》(国家税务总局公告2015年第76号)第十四条规定，跨地区（省、自治区、直辖市和计划单列市）经营汇总纳税企业（以下简称汇总纳税企业）的优惠事项，按以下情况办理：
（一）分支机构享受所得减免、研发费用加计扣除、安置残疾人员、促进就业、部分区域性税收优惠（西部大开发、经济特区、上海浦东新区、深圳前海、广东横琴、福建平潭），以及购置环境保护、节能节水、安全生产等专用设备投资抵免税额优惠，由二级分支机构向其主管税务机关备案。其他优惠事项由总机构统一备案。
（二）总机构应当汇总所属二级分支机构已备案优惠事项，填写《汇总纳税企业分支机构已备案优惠事项清单》（见附件3），随同企业所得税年度纳税申报表一并报送其主管税务机关。
4、企业享受优惠政策后，汇算清缴期内未备案的怎么办？
答：根据《企业所得税优惠政策事项办理办法》（国家税务总局〔2015〕76号）规定，企业已经享受税收优惠，但在汇缴期间未按照规定备案的，应在发现后及时补办备案手续，同时提交《目录》列示优惠事项对应的留存备查资料。税务机关发现后，应当责令企业限期备案，同时提交《目录》列示优惠事项对应的留存备查资料。
对于上述情形，税务机关审核企业相关资料后符合税收优惠政策条件的，应当按照税收征管法有关未按规定报送相关资料处罚。对于经审核不符合税收优惠政策条件的，应当取消所享受优惠，追缴税款，加收滞纳金。
5、企业所得税季度申报表《不征税收入和税基类减免应纳税所得额明细表（附表1）》第30栏有体现“新产品、新工艺、新技术研发费用加计扣除”，研发费用加计扣除是否可以在季度预缴时享受？
答：根据《国家税务总局关于发布<企业所得税优惠政策事项办理办法>的公告》(国家税务总局公告2015年第76号) 附件1《企业所得税优惠事项备案管理目录(2015年版)》规定，开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用加计扣除是在汇算清缴时享受,季度预缴时不享受此项税收优惠政策。
6、企业当年实际发生费用，未能及时取得该费用的有效凭证，是否可以在企业所得税税前扣除？
答：《国家税务总局关于企业所得税若干问题的公告》(国家税务总局公告2011年第34号)规定：“六、关于企业提供有效凭证时间问题，企业当年度实际发生的相关成本、费用，由于各种原因未能及时取得该成本、费用的有效凭证，企业在预缴季度所得税时，可暂按账面发生金额进行核算;但在汇算清缴时，应补充提供该成本、费用的有效凭证。”
7、自2016年1月1日起，高新技术企业跨认定机构管理区域迁移的，是否需要申请重新认定？
答：根据《科技部 财政部 国家税务总局关于修订印发<高新技术企业认定管理办法>的通知》（国科发火〔2016〕32号）第十八条规定，跨认定机构管理区域整体迁移的高新技术企业，在其高新技术企业资格有效期内完成迁移的，其资格继续有效；跨认定机构管理区域部分搬迁的，由迁入地认定机构按照本办法重新认定。
8、2016年度的年终奖，企业到2017年才发放，可以在2016年度的企业所得税汇算清缴前扣除吗？
答：根据《国家税务总局关于企业工资薪金和职工福利费等支出税前扣除问题的公告》（国家税务总局公告2015年第34号）第二条规定，企业在年度汇算清缴结束前向员工实际支付的已预提汇缴年度工资薪金，准予在汇缴年度按规定扣除。
因此，企业在2016年度汇算清缴结束前向员工实际支付的的工资薪金，准予在2016年度汇算清缴按规定扣除。
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